午夜加場!黃立民老師上課! 2020.3.5
今天阿中很辛苦晚上加場,我也來加場XD
我對於近日有報導新冠病毒演化出L和S兩個亞型的新聞很在意,所以來整理一下。
背景:
1.中國科學院於3月3日發表論文《關於新冠病毒的起源和持續進化》,對全世界各地上傳的103個新冠病毒全基因組進行分析,發現新冠病毒已經演化出L和S兩個亞型。103株中101個屬於這兩個亞型。
2.許多侵襲人類的冠狀病毒來源都有可能是蝙蝠。S亞型和蝙蝠的冠狀病毒在演化樹上更接近,預測S亞型是相對較古老的。L亞型則比較新。
3.從佔比上看,L亞型更為普遍達到70%,S亞型佔30%。
4.以時間序來看,L亞型則在武漢爆發的早期階段更為普遍,而L亞型的發生頻率在2020年1月初後有所下降。
5.根據以上發現,作者推論,人為的感控措施干預可能對於L亞型有了壓制的效果。雖然他是比較新的病毒,猜測毒力還有傳播力可能都較高。
S亞型比較原始,毒力還有傳播力可能較低,但因為受到的選擇壓力相對較弱,後來反而比例比較多。
黃立民老師:
1.新冠病毒是RNA病毒(相對於DNA病毒,RNA病毒比較不穩定),一直在傳播的過程中會產生變異。
2.L和S兩個亞型是一個胺基酸不同,這似乎會改變傳染效率和疾病嚴重程度。
3.一開始是傳染效率比較高的,疾病嚴重程度比較高的L亞型佔優勢。但後來這變成劣勢,因為這種病人很容易被辨識而隔離起來,就不容易傳。
4.一旦人為介入,比較低調的S亞型反而佔優勢(傳染效率比較低的,疾病嚴重程度比較低的)。S亞型傳得稍慢,臨床上比較安靜,症狀比較輕微,目前就變多了。
5.目前突變的位置不在PCR偵測/藥物或疫苗研發的重要位置上面。
小璧子補充:
1.其實S亞型和L亞型到底傳染效率和疾病嚴重程度怎樣,是作者的猜測。這篇研究其實沒有結合流行病學和臨床資料。這完全是推論。
2.我個人的推測:我同意L亞型疾病嚴重程度可能較高,這可以解釋武漢一開始看到的高致死率,然後出了武漢很多地方致死率似乎就沒這麼高。
但我會猜測S亞型傳染力不一定比較慢。輕症多無症狀多讓他更容易傳播,讓他在武漢封城前被諸多輕症者帶出武漢,散到全世界。
3.世界各國流行的亞型很可能也有所不同,可能可以部份解釋為何在伊朗,義大利的致死率較高。
4.這麼短時間病毒就變異了會令人擔心。你可能會擔心,會不會在台灣流行的病毒株忽然又變成疾病嚴重程度高?
生命會找到出路。長久看下來,病毒通常會往和人類和平共存的方向演化,這樣的病毒才容易常存在人類世界。如果太毒的,宿主太快就住院被隔離甚至死亡,病毒根本傳不出去。這點倒是不用太擔心。
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