用深度神經網路求解「薛丁格方程式」,AI 開啟量子化學新未來
作者 雷鋒網 | 發布日期 2021 年 01 月 02 日 0:00 |
19 世紀末,量子力學的提出為解釋微觀物質世界打開了一扇大門,徹底改變了人類對物質結構及相互作用的理解。已有實驗證明,量子力學解釋了許多被預言、無法直接想像的現象。
由此,人們也形成了一種既定印象,所有難以理解的問題都可以透過求解量子力學方程式來解決。
但事實上能夠精確求解方程式的體系少之又少。
薛丁格方程式是量子力學的基本方程式,即便已經提出七十多年,它的氫原子求解還是很困難,超過兩個電子的氫原子便很難保證精確度。
不過,多年來科學家們一直在努力克服這一難題。
最近,來自柏林自由大學(Freie Universität Berlin) 的科學團隊取得了突破性進展,他們發表的一篇名為《利用深度神經網路解電子薛丁格方程式》的論文,登上《Nature Chemistry》子刊。
論文明確指出:利用人工智慧求解薛丁格方程式基態解,達到了前所未有的準確度和運算效率。該人工智慧即為深度神經網路(Deep-neural-network),他們將其命名為 PauliNet。
在介紹它之前,我們先來簡單了解薛丁格方程式。
什麼是薛丁格方程式?
薛丁格方程式(Schrödinger Equation),是量子力學中的一個基本方程式。又稱薛丁格波動方程式(Schrödinger Wave Equation),它的命名來自一位名為埃爾溫·薛丁格(Erwin Schrödinger)的奧地利物理學家。
Erwin 曾在 1933 年獲得諾貝爾物理學獎,是量子力學奠基人之一。他在 1926 年發表的量子波形開創性論文中,首次提出了薛丁格方程式。它是一個非相對論的波動方程式,反映了描述微觀粒子的狀態隨時間變化的規律。
具體來說,將物質波的概念和波動方程式相結合建立二階偏微分方程式,以描述微觀粒子的運動,每個微觀系統都有一個相應的薛丁格方程式,透過「解方程式」可得到波函數的具體形式以及對應的能量,從而了解微觀系統的性質。
薛丁格方程式在量子力學的地位,類似牛頓運動定律在經典力學的地位,在物理、化學、材料科學等多領域都有廣泛應用價值。
比如,應用量子力學的基本原理和方法研究化學問題已形成「量子化學」基礎學科,研究範圍包括分子的結構、分子結構與性能之間的關係;分子與分子之間的相互碰撞、相互作用等。
也就是說,在量子化學,透過求解薛丁格方程式可以用來預測出分子的化學和物理性質。
波函數(Wave Function)是求解薛丁格方程式的關鍵,在每個空間位置和時間都定義一個物理系統,並描述系統隨時間的變化,如波粒二象性。同時還能說明這些波如何受外力或影響發生改變。
以下透過氫原子求解可得到正確的波函數。
不過,波函數是高維實體,使捕獲特定編碼電子相互影響的頻譜變得異常困難。
目前在量子化學領域,很多方法都證實無法解決這難題。如利用數學方法獲得特定分子的能量,會限制預測的精確度;使用大量簡單的數學構造塊表示波函數,無法使用少數原子進行計算等。
在此背景下,柏林自由大學科學團隊提出了一種有效的應對方案。團隊成員簡‧赫爾曼(Jan Hermann)稱,到目前為止,離群值(Outlier)是最經濟有效的密度泛函理論(Density functional theory ,一種研究多電子體系電子結構的方法)。相比之下,他們的方法可能更成功,因在可接受計算成本下提供前所未有的精確度。
PauliNet:物理屬性引入 AI 神經網路
Hermann 所說的方法稱為量子蒙地卡羅法。
論文顯示,量子蒙地卡羅(Quantum Monte Carlo)法提供可能的解決方案:對大分子來說,可縮放和並行化,且波函數的精確性只受 Ansatz 靈活性的限制。
具體來說,團隊設計一個深層神經網路表示電子波函數,這是一種全新方法。PauliNet 有當成基準內建的多參考 Hartree-Fock 解決方案,結合有效波函數的物理特性,並使用變分量子蒙地卡洛訓練。
弗蘭克‧諾(Frank Noé)教授解釋:「不同於簡單標準的數學公式求解波函數,我們設計的人工神經網路能夠學習電子如何圍繞原子核定位的複雜模式。」
電子波函數的獨特特徵是反對稱性。當兩個電子交換時,波函數必須改變符號。我們必須將這種特性構建到神經網路體系結構才能工作。
這類似包立不相容原理(Pauli’s Exclusion Principle),因此研究人員將該神經網路體系命名為「PauliNet」。
除了包立不相容原理,電子波函數還具有其他基本物理特性。PauliNet 成功之處不僅在於利用 AI 訓練數據,還在將這些物理屬性全部整合到深度神經網路。
對此,FrankNoé 還特意強調說:
「將基本物理學納入 AI 至關重要,因為它能夠做出有意義的預測,這是科學家可以為 AI 做出有實質性貢獻的地方,也是我們關注的重點。」
實驗結果:高精確度、高效率
PauliNet 對電子薛丁格方程式深入學習的核心方法是波函數 Ansatz,它結合了電子波函數斯萊特行列式(Slater Determinants),多行列式展開(Multi-Determinant Expansion),Jastro 因子(Jastrow Factor),回流變換(backflow transformation,),尖點條件(Cusp Conditions)以及能夠編碼異質分子系統中電子運動複雜特徵的深層神經網路。如下圖:
論文中,研究人員將 PauliNet 與 SD-VMC(singledeterminant variational,標準單行列式變分蒙地卡羅)、SD-DMC(singledeterminant diffusion,標準單行列式擴散蒙地卡羅)和 DeepWF 進行比較。
實驗結果顯示,在氫分子(H_2)、氫化鋰(LiH)、鈹(Be)以及硼(B)和線性氫鏈 H_10 五種基態能量的對比下,PauliNe 相較於 SD-VMC、SD-DMC 以及 DeepWF 均表現出更高的精準度。
同時論文中還表示,與專業的量子化學方法相比──處理環丁二烯過渡態能量,其準確性達到一致性的同時,也能夠保持較高的計算效率。
開啟「量子化學」新未來
需要說明的是,該項研究屬於一項基礎性研究。
也就是說,它在真正應用到工業場景之前,還有很多挑戰需要克服。不過研究人員也表示,它為長久以來困擾分子和材料科學的難題提供了一種新的可能性和解決思路。
此外,求解薛丁格方程式在量子化學領域的應用非常廣泛。從電腦視覺到材料科學,它將會帶來人類無法想像的科學進步。雖然這項革命性創新方法離落地應用還有很長的一段路要走,但它出現並活躍在科學世界已足以令人興奮。
如 Frank Noé 教授所說:「相信它可以極大地影響量子化學的未來。」
附圖:▲ Ψ 表示波函數。
資料來源:https://technews.tw/2021/01/02/schrodinger-equation-ai/?fbclid=IwAR340MNmOkOxUQERLf4u3SK0Um6VQVBpvEkV_DxyxIIcUv8IP88btuXNJ6U
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***** Geek Series 3-1*****
無限的力量-- 微積分如何揭露宇宙的奧秘
"It's the language God talks" -- Richard Feynman telling Herman Wouk about calculus
非常符合時事的一本書。話說1665年倫敦大瘟疫的時候,人在劍橋大學的牛頓被要求在家自主健康管理。也就是宅在家的這段時間,22歲的牛頓發展出早期微積分的數學基礎,真的是Work from home (在家工作)的典範啊!
由美國康乃爾大學知名的應用數學教授所寫的這本書,讓數學變得很有人性,也充分描繪了微積分的美感。微積分在物理學家費爾曼口中是“上帝的語言”,雖然看起來很艱難,但作者開宗明義說不要以貌取人,因為微積分的精神,是讓複雜的事情變簡單!
“Calculus is defined by its credo, to solve a hard problem about anything continuous, slice it into infinitely many parts and solve them. By putting the answers back together, you can make sense of the original whole. I've called this credo the Infinity Principle"
(微積分的定義正如它的核心信念-- 如果要解決一個關於連續性的問題, 先把問題切成無限多的小塊然後找尋解答,當你把那些答案加總回去時,就能拼湊出原本的全貌,我稱這個信念為“無限的原則”)
曲線就是一種連續改變的方向
移動就是一種連續改變的位置
整本書貫穿科學史,可以看到微積分是如何從跨領域的激盪才發現出來的。阿基米德思考曲線或是球體的容積。天文學家哥白尼和克卜勒從觀察星球發現特殊的星球運動行為,為日後牛頓三定律鋪路。身兼哲學家和數學家的笛卡兒如何一邊發展他的理論,一邊把業餘數學家費馬 (Fermat)當成假想敵不斷嗆聲。牛頓在家辦公的成就讓十七世紀開始大放異彩。其中微分方程的應用蓬勃發展,像是超級怕冷整年穿著衛生衣的傅立葉發展出熱傳導公式(衛生衣是我自己加的,怕冷是真的)。冷戰時期的科學家計算雷達訊號,以及“關鍵少數”故事中太空時代大量用微積分判斷降落路徑的“電腦”-- 一群用筆算數的女人們。
現代應用更加多元。沒有微分和微分方程,就不會有GPS定位,不會有愛滋病雞尾酒療法,也不會有String theory 而發明的微波爐和音樂合成器。
沒有積分,就沒有整形手術需要的建模,也沒有電腦動畫的史瑞克。
最後作者談到微積分的未來,特別是面對許多非線性的問題,例如生物和社會科學的領域。隨著大數據的採集,人工智慧還DNA科學的發展,微積分還有好多待開發的應用。當我們思考渺小的人類竟然可以預測光年之外黑洞的行為,同時發現自然界每一處都像是精心設計的演算法和程式編碼,等待著我們發覺,就真的覺得這個“上帝的語言”,讓人興奮期待,也讓人敬畏謙卑。
全文與作者在YouTube上的小故事在部落格中👇👇👇
https://dushuyizhi.net/infinite-powers-%e7%84%a1%e9%99%90%e7%9a%84%e5%8a%9b%e9%87%8f-%e5%be%ae%e7%a9%8d%e5%88%86%e5%a6%82%e4%bd%95%e6%8f%ad%e9%9c%b2%e5%ae%87%e5%ae%99%e7%9a%84%e5%a5%a7%e7%a7%98/
#Infinitepowers #Calculus #math #isaacnewton #牛頓 #微積分
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武漢肺炎爆發以來,疫情洶洶、人心惶惶,各方面的消息都很亂;在風聲鶴唳下,草木皆兵所有人都為之亂神。
人類是種有理性的動物,但一群人類就不是了,當我們在看動物頻道上的牛馬群狂奔、魚群鳥群竄動時,其實我們也沒有好到哪裡去。
所以當消息一出,我們搶口罩、搶酒精、搶消毒棉,甚至搶衛生紙,弄得疫情還沒爆,糖尿病患幾乎沒消毒棉用、前線醫護人員沒有口罩可戴;我真的相信有人家裡面屯著上千片的口罩,然後額手稱慶的看著船邊水中那些人伸著手亂划。
我只能祈禱大家安全下莊,讓他們看著上千片的口罩想著要煮什麼口味的口罩湯.....
而所有事態都一樣,只要鬧得夠久,事態發展跟正反兩邊的訊息不斷湧出後,就會讓人難分真偽甚至是對錯。
只是這通常是包括加害者、受害者與政治立場或既得利益產生衝突的事物;相較之下,某些事務則是不受影響的始終中立。
而這些事務的中立是來自於它們不會受到政治或主客觀立場的干預而產生改變,例如科學定律。
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而台灣本來就有某些人是盲目的,他們在平日裡看似理性,卻常用不理性的角度解讀來源片面的情報,然後散布奇怪的消息;實在很難不懷疑瞎搶物資囤貨的就是這種人起頭的.......
我常常在這個專頁裡面呼籲大家要有獨立思考能力、要能夠解讀與多方面思考不同的消息來源,這是一種具備科學性的思維模式。
只有習慣用理性思考、多角度思維去查探、用科學角度去找證據,我們才能去做那個謠言止於己身的智者,也才能避免散播謠言或是被謠言所迷惑;尤其,當你就是那個會將關心資訊分享給親友的人,你就更有必要釐清資訊來源,才能避免好心做壞事。
昨天晚上我就遇到一個,還自稱為人師的;差點沒把我鼻子氣歪了......
在我遇到那個奇人後,我只能說 : 有獨立思考的能力是需要的,但有足夠的知識常識來支撐思考與推敲則是必要的。
不然,終將只能成為一個立場堅定卻說著渾話的人,終究還是可能害人害己。
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平日裡,台灣人就很注重消毒。
消毒很重要,但除卻洗澡、洗頭、洗手、刷牙之外,其他的消毒可能有99%都是不必要的。
更正確來說,消毒本身就是一個假議題;因為沒必要,而且也做不來。(這個話題,以後有機會我想用一個篇幅來好好吐槽一下....)
但台灣人卻在媒體列舉了各種東西都比馬通髒幾千倍幾萬倍的軟性恐嚇下,開始迷信各種消毒商品;又在各種商業文宣下,相信甚至迷信的搶購各種消毒用品。
現在又正值防止疫情失控的當下,這種精神式潔癖就更嚴重了。
於是,香皂不能滿足大家了,大家要有殺菌效果的洗手乳;洗手乳不夠看,大家還有要乾洗手,然後又覺得添加什麼精油或厲害的不知名成分更威猛。
而環境與自身消毒藥劑也不能只是簡單的稀釋漂白水或酒精,最好是名字越複雜感覺就越有效。
就像是"鹹酥雞"看起來就只值50塊,但叫做"去骨醃漬炸雞肉佐台式風味羅勒"就能有異國風清,就能值450元的高價了。
所以,漂白水、酒精,聽起來就很LOW,次氯酸水聽起來就很猛了;然後又不能免俗地給個台式名稱,大家居然就又買單了。
所以"水神"之名橫空出世;就如同網路上那堆比宅男還多的宅男女神一樣又廉賤又輕易封神。
但是,這些人真的知道其中的差異為何嗎?
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剛剛說到為什麼化學定律不會騙人?
因為它是把很複雜事情用很簡單方式表示,而且能成為全世界共通語言的一種型態。
其實數學也不會騙人,因為不會就是不會.......
簡單說,你可以不懂外國語言,但當你要跟外國人討論數學或是化學(或是音樂)時,把公式列出來(把節奏彈出來),那就能直接溝通了。
而這種世界共通的專業語言,卻異常有效,還正確的顛撲不破。(因為"定律"本身就是具備嚴格定義的)
我書沒念好,所以在學生時代時我總是想著為什麼要學化學、數學,搞的這麼難,我們的生活中也用不到不是嗎?
但長大了、眼界開一點後,我才知道不是這麼難的數學本身無用,而是我們生活層次用不到這麼難的數學;但不表示它沒用(大概是我們自己沒用吧.....)。
大家看過一部電影叫做《關鍵少數》吧?
這是一部傳記式電影。它講的是三個主要的非裔女性,如何在飽受歧視的年代,幫助美國太空總署在太空競爭時代能取回主導權的過程。
這三位劃時代的里程碑人物是憑藉著什麼完成任務、取得眾人尊重,並且成為影響美國太空總署至今的成就呢?
她們數學很好,而且是要命的那種好。
她們能以數學來驗證太空梭在地球、在空中、在太空然後降落的軌道、座標與太空船裝置上的各種抗性、承受力與各種相關數據。
說的簡單點,她們能用數學證明太空梭飛上去之後的各種狀況,然後提出證實有效的解方與改善依歸。
這證明兩件事 : 數學不會騙人,不會就是不會!! And 是我們不會用,不是數學沒用。
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講故事跟電影,好像離我們太遠;好像我是看了傳記電影很感動,所以相信它是真的;那我們來談談現實中我遇過的事。
在我念高二的時候,有一天放學時我看見我們班上的衛生股長非常認真的在刷地,我走過去看時,旁邊站著一罐通樂;我問他說 : 這哪招?
他很得意的說 : 我發現用通樂來刷地板,地板會變得非常乾淨,超級有效。
而跟著我進來的班導師臉色大變(我是化工科,導師周國英先生是老化工人了),他急著喝斥大家先把外面的地板沖乾淨,然後進教室去。
當我們進去後,他已經在黑板上寫了化學反應式,還氣急敗壞的罵著搞不清楚狀況的衛生股長。他解釋說,用鹽酸洗石子地,看起來很快很乾淨,但是會損傷石子磚的表面,原因是因為鹽酸跟大理石中主要的成分反應後會侵蝕大理石。
我把化學反應式列給大家看 : CaCO³+2HCl ---> CaCl²+CO²+H²O
(白話文 : 碳酸鈣+鹽酸_反應後會變成_氯化鈣+二氧化碳+水 )
這會發生什麼事?
反應之後的氯化鈣會溶於水,然後被我們沖進排水溝裡;而反應後的二氧化碳會跑到空氣中;於是留下來的就是被侵蝕成坑坑洞洞的地板。
聽完之後,老師帶我們回到走廊上,看著地面的坑洞,我們目瞪口呆。
從那時候我就知道兩件事 : 化學、科學不會騙人。AND,不是化學不管用,是我們不會用。
所以前幾天,家人告訴我有個富豪為了給年輕女朋友做排場,就叫了許多朋友來家裡開慶生派對,又倒了幾十公斤的乾冰到進游泳池裡製造煙霧效果..........才聽到這裡,看著電視的我就問 : 所以死幾個人?
家人很意外又不意外地反問 : 你怎麼知道會死人?
#因為化學不會騙人
請記住 : #沒有未卜先知_只有見微知著
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#再說回我遇到的那個神奇女老師
引起我注意的不是她有多推崇次氯酸水,而是她的那句 : 酒精揮發後會完全沒殘留嗎?酒精可以嗎?泡過酒精的食物能夠直接下肚嗎?
酒精不一定是最好的喔~
#這我就納悶了
(你X的沒吃過燒酒雞?)
所以我非常好奇,她覺得酒精會殘留的根據是什麼?
是她看了什麼論文報告?還是她以什麼驚人的化學學理突破,才會說出這麼超出我想像的論點。
於是我請問她說這個話的依據是什麼,能否用化學平衡式的表現方法來簡單說明?
#然後她就爆了
叫我自己去估狗......這些化學式,只要高中程度,智商90以上,姑狗一下都會理解.....(說我請她列出化學式的行為是)好比抓著教你微積分的教授問他能不能證明九九乘法一樣的心態.............
#然後還是沒有正面回答我她憑什麼說酒精會殘留
她說對了一項,這是有高中程度都會知道的事情(但從她暴怒且左右迴避的言論看來,她沒有高中程度)
酒精可以跟很多東西反應,但揮發可以參考這個化學平衡式 : CH3CH2OH + 3O2 → 2CO2 + 3H2O
在這個化學式裡面,酒精碰到氧氣,會變成二氧化碳跟水;這裡面的二氧化碳會跑到空氣中,水會在揮發過程中被帶走或是被我們的體溫帶走。(然後過程中也會把我們的體溫帶走,所以我們會覺得涼涼的)
所以,如果你買的酒精裡面就只有酒精(加水稀釋),那它在揮發後是不會有殘留的。
因為化學不會騙人,所以我可以以此懷疑她唬爛。(就這麼簡單)
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有趣的是,她寫一堆來迴避我的簡單提問過程中,甚至還說 : 她也會在上課時跟小小孩討論,要有獨立思考能力,只是建議不要只對酒精有迷思,提出另一種思考模式而已............
這種似是而非的言論,讓我知道原來她沒有證據,只是覺得不要迷信酒精,所以反過來懷疑酒精...........這種思考是對的嗎?
其實,沒錯。
但錯的是 : 妳大膽假設了之後,妳拿什麼證據來支持自己的觀點?
沒有。那就是造謠、就是騙人、就是無的放矢,那就是反科學。
妳要黑酒精,沒問題,但拿出證據吧?
有殘留?🤔
根據是化學平衡式?人體實驗?期刊論文?
總不會自己答不出來,沒有證據,然後自己的發言連估狗程度都沒有,就只會叫人估狗吧?
她提出思考模式,很好!
證據呢?
她要懷疑迷思,很棒!
根據呢?
就如同我們可以懷疑希特勒是變性人嗎?
可以啊!證據呢?
大家可以懷疑李小龍、張國榮尚在人間?
可以啊!證據呢? (我是真的希望他們兩個都沒死啦....但我沒有證據)
很多人唸小學時牆上總貼著「大膽懷疑,小心求證」,我想大家要認真想想其中意涵是什麼?只是為了對仗嗎?
這叫做獨立思考能力?
不。這叫誤人子弟。
化學是只是討論科學問題的基本共同語言。只有在這個基礎上討論化學問題才客觀並有意義,而不是誰誰的主觀感受與懷疑。
吳萼洋覺得蜂蜜檸檬可以預防武漢肺炎,可能那個宮廟也覺得符水有效,都可以。但這是科學問題啊,要叫證據的。
她還說自己服務單位的園方有充足的酒精,也預約裝設次氯酸製造機,還評比了很多廠商..............
要是我的孩子在他們園裡就讀,那我會當個奧客去看看他們到底拿什麼當作評估的標準;要是真的敢拿她口中的神水(次氯酸水)噴在孩子身上,我絕對讓他們上電視接受訪問。
#但還好我不是
最後提醒大家一件事 : 我們很生猛的中研院跟國家衛生研究院先後對武漢肺炎的篩檢跟疫苗做出重大突破的研究成果,但你們猜猜他們動物飼養房間跟實驗操作台與各種器具的消毒殺菌是用什麼呢?
就是酒精跟稀釋的漂白水(次氯酸鈉水)
人家科學前線的機構都用這麼"原始"卻又極有效果的方式在消毒,一堆人在那邊裝什麼上帝?
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#有幾分證據說幾分話
#她以為的獨立思考_其實誤人子弟
#妳大膽假設了_那妳的求證呢?
#名字比較複雜不表示比較有效
#最簡單的往往會有最好的效果
#台灣很有趣
#民粹團體上街比各國核能專家畢生研究還牛
#現在連幼兒園老師都覺得自己比那些專家還懂化學了
#撿到機關槍
#我知道很長_但我不想分兩篇_我先去喬一下氣歪的鼻子
#開學了
#回到上班上課沒休假的時光
#所以發文無法準時
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看完特映,一直不知道如何下筆寫這部電影的感受
最後決定寫了再說(文長先抱歉啦哈哈)。
故事簡單來說在敘述1960年代美國種族隔離政策底下,三位於NASA工作的黑人女性
如何靠自身的能力及努力取得認同
進而協助太空人約翰葛倫完成人類史上第一次地球繞行的太空任務。
先來談談三位女角,主角泰拉姬·P·漢森原本就是奧斯卡等級的實力派演員
奧塔薇亞·史班森也在”姊妹”這部電影奠定了她的影壇地位
最後一位賈奈兒·夢內雖不是演員出身,在這部片中卻讓人印象深刻
特別想提片中的法庭戲,整場戲相當有自信且情緒飽滿
釋放的時刻相當令人感動,沒有大鳴大放,相當穩定的表現。
或許是東方人的情感壓抑
一直對於美劇或好萊塢片中黑人演員的表現方式不太能產生共鳴
總會覺得一切的釋放太理所當然。
但在這部電影卻被表現得恰到好處,真心的替主人翁開心
並感受他所受的痛苦及樂觀的態度。
這部片不僅談到黑人女性面對當代性別及種族歧視如何透過自身的能力及努力去克服
更令我喜愛的是數學這個元素,畢竟數學是對所有性別人種都公平的
而且只有人類可以創造不存在世上的數學公式
因為我們比電腦多了創造力以及情感。
我相當喜歡片中女主角的某句話
她說:是的,強森先生,女人可以在NASA工作,而且不是因為我們穿裙子
是因為我們戴眼鏡。
去看這部電影吧,你一定不會後悔。
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